Logo bs.boatexistence.com

Kako se radi metagenomika?

Sadržaj:

Kako se radi metagenomika?
Kako se radi metagenomika?

Video: Kako se radi metagenomika?

Video: Kako se radi metagenomika?
Video: Amplicon sequencing 2024, Maj
Anonim

Metagenomika je definisana kao direktna genetska analiza genoma sadržanih u uzorku životne sredine Polje je prvobitno počelo kloniranjem DNK životne sredine, nakon čega je usledio funkcionalni skrining ekspresije [1], a zatim je brzo dopunjen direktnim slučajnim sekvencioniranjem ekološke DNK [2, 3].

Šta je proces metagenomije?

Metagenomika uključuje dobijanje DNK od svih mikroorganizama unutar zajednice, bez nužnog identifikovanja svih uključenih vrsta. Nakon što se geni sekvencioniraju i uporede sa identifikovanim sekvencama, funkcije ovih gena se mogu odrediti.

Koja se tehnika koristi u metagenomici?

Uzorak mikrobne zajednice se prikuplja iz morske vode, sedimenta, životinje domaćina ili drugog morskog staništa. Sakupljene ćelije se zatim liziraju i DNK se ekstrahuje iz njihovog lizata. Tehnika koja omogućava metagenomiku je sekvenciranje sačmaricama, koja sekvencira nasumične regije DNK na neciljani način.

Koja su 3 koraka za proučavanje metagenomije?

Koraci i proces metagenomike:

  1. Uzorak kolekcije:
  2. vađenje DNK:
  3. Priprema uzorka:
  4. Uzorak analize:

Kako se izvodi funkcionalna metagenomika?

Funkcionalna metagenomika uključuje izolaciju DNK iz mikrobnih zajednica radi proučavanja funkcija kodiranih proteina. To uključuje kloniranje fragmenata DNK, ekspresiju gena u surogat domaćinu i skrining za enzimske aktivnosti.

Preporučuje se: