Metagenomika je definisana kao direktna genetska analiza genoma sadržanih u uzorku životne sredine Polje je prvobitno počelo kloniranjem DNK životne sredine, nakon čega je usledio funkcionalni skrining ekspresije [1], a zatim je brzo dopunjen direktnim slučajnim sekvencioniranjem ekološke DNK [2, 3].
Šta je proces metagenomije?
Metagenomika uključuje dobijanje DNK od svih mikroorganizama unutar zajednice, bez nužnog identifikovanja svih uključenih vrsta. Nakon što se geni sekvencioniraju i uporede sa identifikovanim sekvencama, funkcije ovih gena se mogu odrediti.
Koja se tehnika koristi u metagenomici?
Uzorak mikrobne zajednice se prikuplja iz morske vode, sedimenta, životinje domaćina ili drugog morskog staništa. Sakupljene ćelije se zatim liziraju i DNK se ekstrahuje iz njihovog lizata. Tehnika koja omogućava metagenomiku je sekvenciranje sačmaricama, koja sekvencira nasumične regije DNK na neciljani način.
Koja su 3 koraka za proučavanje metagenomije?
Koraci i proces metagenomike:
- Uzorak kolekcije:
- vađenje DNK:
- Priprema uzorka:
- Uzorak analize:
Kako se izvodi funkcionalna metagenomika?
Funkcionalna metagenomika uključuje izolaciju DNK iz mikrobnih zajednica radi proučavanja funkcija kodiranih proteina. To uključuje kloniranje fragmenata DNK, ekspresiju gena u surogat domaćinu i skrining za enzimske aktivnosti.
