BLAST je kompjuterski algoritam koji je dostupan za upotrebu na mreži na web stranici Nacionalnog centra za biotehnološke informacije (NCBI), kao i na mnogim drugim stranicama. BLAST može brzo uskladiti i uporediti DNK sekvencu upita sa bazom podataka sekvenci, što ga čini kritičnim alatom u tekućim genomskim istraživanjima.
Je li BLAST primarna baza podataka?
BLAST je najrasprostranjeniji softver u istraživanju bioinformatike. Njegova glavna funkcija je da uporedi sekvencu od interesa, sekvencu upita, sa sekvencama u velikoj bazi podataka BLAST, a zatim prijavljuje najbolja podudaranja, ili "pogotke", pronađene u bazi podataka. Ovaj jednostavan program ima dvije primarne aplikacije.
Je li NCBI baza podataka?
NCBI sadrži niz baza podataka relevantnih za biotehnologiju i biomedicinu i važan je resurs za bioinformatičke alate i usluge. Glavne baze podataka uključuju GenBank za sekvence DNK i PubMed, bibliografsku bazu podataka za biomedicinsku literaturu. Ostale baze podataka uključuju NCBI Epigenomics bazu podataka.
Da li je BLAST zaposlen samo u NCBI bazama podataka?
BLAST je dostupan na webu na NCBI web stranici. Dostupne su različite vrste BLAST-ova prema sekvencama upita i ciljnim bazama podataka.
Kako radi baza podataka BLAST?
Kako BLAST radi? BLAST identifikuje homologne sekvence koristeći heuristički metod koji inicijalno pronalazi kratka podudaranja između dve sekvence; prema tome, metoda ne uzima u obzir cijeli prostor sekvence. Nakon početnog meča, BLAST pokušava započeti lokalna poravnanja od ovih početnih utakmica.
