BigWig je format datoteke za prikaz gustih, kontinuiranih podataka u tragu pretraživača genoma, kreiran konverzijom iz Wiggle (WIG) formata. BigWig format je opisan na web stranici UCSC Genome Bioinformatics, a vodič za format datoteke Broad Institute pruža dodatne informacije.
Šta je bigWig format?
format bigWig je za prikaz gustih, kontinuiranih podataka koji će biti prikazani kao grafikon BigWig fajlovi se inicijalno kreiraju iz datoteka tipa WIG, koristeći UCSC program wigToBigWig. Alternativno, bigWig fajlovi se mogu kreirati iz bedGraph fajlova, koristeći UCSC program bedGraphToBigWig.
Kako da koristim bigWig fajl?
Premjestite novokreirani bigWig fajl (myBigWig.bw) na web-pristupačnu http, https ili ftp lokaciju. Zalijepite URL u obrazac za unos prilagođene staze ili napravite prilagođenu stazu koristeći jednu liniju staze. Zalijepite prilagođenu liniju staze u okvir za tekst na stranici za upravljanje prilagođenom stazom.
Šta je bigWig track?
bigWig Tracks su traze za kontinuirane signale kroz cijeli genom. Pogodni su za prikazivanje različitih "sirovih" rezultata eksperimenta kao što su ChIP-Seq signali, RNA-Seq signali, itd.
Kako da kreiram bigWig fajl?
Postoji više načina za generiranje velikih fajlova. Ovo obično uključuje pretvaranje. bam datoteku u wiggle track (. wig) i zatim pretvaranje trake za pomicanje u binarnu bigwig (.
