Kako se sds vezuje za protein?

2024 Autor: Fiona Howard | [email protected]. Zadnja izmjena: 2024-01-10 06:35

SDS se snažno vezuje za pozitivno nabijene i hidrofobne ostatke proteina preko svojih sulfatnih grupa i alkilnih lanaca , odnosno ^{13 Prema tome, to je vrijedan deterdžent u polju strukturalne biologije i studija savijanja/odmotavanja proteina.}

Šta SDS radi proteinu?

SDS je amfipatski surfaktant. On denaturira proteine vezujući se za proteinski lanac svojim ugljovodoničnim repom, otkrivajući normalno zakopane regije i oblažući proteinski lanac molekulima surfaktanta. Grupa polarnih glava SDS-a dodaje dodatnu prednost upotrebi ovog denaturanta.

Kako se SDS vezuje za aminokiseline?

SDS ima hidrofobni rep koji snažno stupa u interakciju sa proteinskim (polipeptidnim) lancima. Broj SDS molekula koji se vezuju za protein je proporcionalan broju aminokiselina koje čine protein Svaki SDS molekul daje dva negativna naboja, nadmašujući svaki naboj koji protein može imati.

Da li SDS oblaže proteine?

SDS takođe oblaže protein uniformnim negativnim nabojem, koji maskira unutrašnje naboje na R-grupama. SDS se prilično ravnomjerno vezuje za linearne proteine (oko 1,4g SDS/1g proteina), što znači da je naboj proteina sada približno proporcionalan njegovoj molekulskoj težini.

Kako SDS daje proteinima negativan naboj?

SDS je deterdžent koji sadrži dug alifatski lanac i sulfatnu grupu. Ovaj deterdžent stupa u interakciju sa denaturiranim proteinima kako bi formirao kompleks s jako negativnim nabojem (negativni naboj koji proizlazi iz SO₄² − ^{grupe SDS). Proteini se prvo denaturiraju toplinom, a zatim se SDS dodaje u velikom višku.}